Contoh Kasus Teori Komputasi

Contoh kasus pertama pada bidang biologi. Topik utama bidang ini meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan bentuk struktur protein maupun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen.

Berikut ini adalah contoh analisa asam amino dari empat protein hemoglobin dengan menggunakan salah satu aplikasi dasar bioinformatika yaitu PenyejajaranSekuens :
Saat ini mata ajaran bioinformatika maupun mata ajaran dengan muatan bioinformatika sudah diajarkan di beberapa perguruan tinggi di Indonesia. Selain itu, riset-riset yang mengarah pada bioinformatika juga telah dilaksanakan, seperti : 
  1. Riset bioinformatika protein dilaksanakan sebagai bagian dari aktivitas riset rekayasa protein pada Laboratorium Rekayasa Protein, Pusat Penelitian Bioteknologi Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI), Cibinong, Bogor.
  2. Lembaga Biologi Molekul Eijkman, Jakarta, secara khusus memiliki laboratorium bioinformatika sebagai fasilitas penunjang kegiatan risetnya.
  3. Basis data sekuens DNA mikroorganisme asli Indonesia sedang dikembangkan di UI. 
Dengan demikian, akan semakin mudah para peneliti dapat mengembangkan obat mau pun vaksin untuk berbagai penyakit yang ada serta mencegah kelainan gen pada manusia.

Contoh kasus ke dua pada bidang Kimia. Sifat-sifat molekul yang dihitung antara lain struktur (yaitu letak atom-atom penyusunnya), energi dan selisih energi, muatan, momen dipol, kereaktifan, frekuensi getaran dan besaran spektroskopi lainnya. Simulasi terhadap makromolekul (seperti protein dan asam nukleat) dan sistem besar bisa mencakup kajian konformasi molekul dan perubahannya (mis. proses denaturasi protein), perubahan fase, serta peramalan sifat-sifat makroskopik (seperti kalor jenis) berdasarkan perilaku di tingkat atom dan molekul. Istilah kimia komputasi kadang-kadang digunakan juga untuk bidang-bidang tumpang-tindah antara ilmu komputer dan kimia.

Terdapat beberapa bidang utama dalam topik ini, antara lain:
  1. Penyajian komputasi atom dan molekul. 
  2. Pendekatan dalam penyimpanan dan pencarian spesi kimia (Basisdata kimia).
  3. Pendekatan dalam penentuan pola dan hubungan antara struktur kimia dan sifat-sifatnya (QSPR, QSAR).
  4. Elusidasi struktur secara teoretis berdasarkan pada simulasi gaya-gaya.
  5. Pendekatan komputasi untuk membantu sintesis senyawa yang efisien.
  6. Pendekatan komputasi untuk merancang molekul yang berinteraksi lewat cara-cara yang khusus, khususnya dalam perancangan obat. 
  7. Simulasi proses transisi fase.
  8. Simulasi sifat-sifat bahan seperti polimer, logam, dan kristal (termasuk kristal cair).
Agar diperoleh proses komputasi yang paling efisien dan akurat dapat dilakukan beberapa pendekatan, seperti :
  1. Kajian komputasi dapat dilakukan untuk menemukan titik awal untuk sintesis dalam laboratorium.
  2. Kajian komputasi dapat digunakan untuk menjelajahi mekanisme reaksi dan menjelaskan pengamatan pada reaksi di laboratorium.
  3. Kajian komputasi dapat digunakan untuk memahami sifat dan perubahan pada sistem makroskopis melalui simulasi yang berlandaskan hukum-hukum interaksi yang ada dalam sistem.
Referensi:
http://id.wikipedia.org/wiki/Kimia_komputasi
http://id.wikipedia.org/wiki/Bioinformatika





Komentar

Posting Komentar

Postingan populer dari blog ini

Dear Adik Laki-Lakiku

Mungkin aku pernah tak menginginkanmu karena takut perhatianku diambil hanya untukmu tapi itu dulu. Dulu sebelum aku tahu rasanya memiliki adik baru. . . Eka adalah panggilan kecilmu yang berarti anak laki-laki pertama dari bapa dan mama. Namun, mungkin karena terlalu berat untukmu karena memang benar laki-laki satu-satunya dari 4 bersaudara. . . Hingga akhirnya dipilihlah Ramdan dari nama akhirmu Ramadhan yang juga berharap penuh keberkahan dan kebaikan akan terus bersamamu. Namamu, doamu. . . Usiamu berkurang satu persatu. Tugasku adalah mengingatkanmu selama samampuku. Suatu saat akan ada amanah besar untukmu maka bersiaplah adikku. Jagalah adik-adik perempuanmu sebelum menjaga yang bukan mahrammu :) . . Dik @raamdn manfaatkan sisa usiamu agar Allah memberkahimu. . . Depok, 23 Desember 2016 Salam kakak perempuanmu ❤
Baca selengkapnya

Pahlawan Kampus

Esok adalah hari dimana kita sebagai warga Indonesia harus memperingati jasa-jasa para pahlawan yang telah berjuang demi kemajuan bangsa. Pertanyaannya adalah bagaimana cara memperingatinya? Terutama bagi seorang mahasiswa seperti saya. Apakah dengan menggelar sebuah acara dan sebagainya?   Dengan mengingat sejarah mengenai para pahlawan kita sudah bias memperingatinya. Masih ingat bukan dengan ”Jasmerah”? Jasmerah merupakan singkatan dari semboyan pidato yang disampaikan Ir. Soekarno pada Hari Ulang Tahun Republik Indonesia (HUT RI) 17 Agustus 1966 yaitu “Jangan sekali-kali  melupakan sejarah.” Lalu bagaimana jika ingin menjadi seorang pahlawan? Untuk memperingati Hari Pahlawan ini bukan berarti kita harus bertumpah darah terlebih dahulu agar bias disebut pahlawan. Atau memakai pakaian layaknya “Batman” di lingkungan kampus untuk disebut pahlawan? Tentu tidak hal seperti ini tidaklah wajar. Definisi seorang pahlawan itu sendiri adalah seseorang yang berjuan...
Baca selengkapnya

Sederhana Dan Sarat Makna

Gambar
Assalamualaikum :) Postan saya kali ini masih berkaitan dengan tugas. Tugas untuk memenuhi mata Kuliah Softskill di kelas 3IA10. Desain ini saya buat menggunakan Photoshop CS6. Desain yang sederhana namun sarat makna sesuai dengan judulnya. Background (Warna Abu-Abu) Menandakan masa depan saya masih misteri dalam arti hanya Allah yang mengetahui Objek (Wanita Berjilbab) Menggambarkan diri saya sendiri yaitu seorang muslimah Simbol (Cabang) Dollar: Jadi orang kaya. Hati: Jatuh hati di waktu yang tepat. Chat: Hanya membicarakan hal yang bermanfaat. Not: Mendengarkan musik-musik positif. Kota Paris: Berharap bisa ke City Of Lights, Paris. Alphabet: Jadi Penulis Roll Kamera: Bisa membuat sebuah film atau berkontribusi di belakang layar sebuah film. Trolley: Bisa belanja apapun yang diinginkan Laki-Laki dan Perempuan: Mendapatkan pasangan yang baik di mata Allah Text ("Kejar akhirat, maka dunia akan mengejarmu.") ...
Baca selengkapnya